DNA-6mA甲基化测序
随着测序技术的快速发展，科研者们在真核生物中（果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等）发现了DNA-6mA的存在，并且发现了DNA-6mA甲基化能影响基因表达.
DNA甲基化检测--重亚硫酸盐的测序法（Bisulfite Genomic Sequence，BSP）
重亚硫酸盐的测序法是一种灵敏的能直接检测分析基因组DNA甲基化模式的方法。重亚硫酸盐处理后，用针对改变后的DNA序列设计特异性引物并进行聚合酶链式反应（PCR）。
利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序
ATAC-seq可以检测染色质开放区域，其原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质区域的特性，对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序和富集分析。